Laboratorium

Wykonujemy badania czynników predykcyjnych, których wykrycie pozwala zakwalifikować chorych na nowotwory do innowacyjnych terapii onkologicznych w ramach programów lekowych oraz badań klinicznych.

Dostępne badania:

w kwalifikacji chorych na niedrobnokomórkowego raka płuca do terapii inhibitorami kinazy tyrozynowej EGFR I, II i III generacji oraz do terapii amiwantamabem (przeciwciało anty-EGFR). Badania te wykonujemy w materiale pobranym z guza nowotworowego (bloczki parafinowe lub preparaty cytologiczne zawierające komórki nowotworowe) oraz we krwi obwodowej w wolnym, krążącym, nowotworowym DNA (badanie to ma ograniczoną czułość w stosunku do badania mutacji w materiale pobranym z guza nowotworowego).

na powierzchni komórek niedrobnokomórkowego raka płuca metodą immunohostochemiczną (IHC) w celu przesiewowego badania nieprawidłowości ALK i kwalifikacji do terapii inhibitorami ALK.

metodą fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH) w komórkach nowotworowych w kwalifikacji chorych na niedrobnokomórkowego raka płuca do terapii inhibitorami ALK i ROS1.

na komórkach nowotworowych i immunologicznych w kwalifikacji chorych na niedrobnokomórkowego raka płuca (oraz innych chorób nowotworowych) do immunoterapii przeciwciałami anty-PD-1 lub anty-PD-L1.

metodą FISH w kwalifikacji chorych na raka piersi i raka żołądka do terapii przeciwciałami anty-HER2 i drobnocząsteczkowymi inhibitorami HER2.

(technika IHC), których zaburzenia ekspresji są odpowiedzialne za powstanie deficytu źle sparowanych zasad (ang. mismatch deficency – dMMR) i niestabilności mikrosatelitarnej (ang. microsatellite instability – MSI), a także badanie samej MSI metodą PCR i sekwencjonowania Sangera w kwalifikacji chorych na nowotworowy do immunoterapii i stwierdzenia rodzinnej predyspozycji do występowania nowotworów 

w kwalifikacji chorych na raka jelita grubego do terapii przeciwciałami anty-EGFR oraz genu KRAS u chorych na NDRP w kwalifikacji do terapii inhibitorami KRAS.

w kwalifikacji do terapii inhibitorami kinaz tyrozynowych BRAF i MEK u chorych na nowotwory.

w kwalifikacji do badań klinicznych i do terapii ukierunkowanych molekularnie refundowanych w ramach NFZ u chorych na różne typy nowotworów.

Receptor kwasu foliowego ułatwia jego transport do komórek nowotworowych w raku jajnika, jajowodu i otrzewnej oraz innych nowotworach. Badanie ekspresji FOLR1 pozwala przewidzieć odpowiedź na leczenie przeciwciałami anty-FOLR1 skoniugowanych z cytostatykami.

Obecność MSI świadczy o zaburzeniach w naprawie DNA w mechanizmie usuwania źle sparowanych zasad. Wykrycie obecności wysokiej niestabilności mikrosatelitarnej (high MSI) może świadczyć o występowaniu dziedzicznej predyspozycji do występowaniu chorób nowotworowych (zespół Lyncha), ale jednocześnie jest czynnikiem kwalifikującym chorych na nowotwory do immunoterapii.
 

- mutacji w genach IDH1 i IDH2 (techniką real-time PCR), metylacji genu MGMT (techniką MS-PCR) oraz obecności kodelecji 1p/19q czy delecji genów CDKN2A/B (techniką FISH).

techniką NGS (mutacje somatyczne i germinalne, wszystkie sekwencje kodujące) lub techniką sekwencjonowania Sangera (tylko najczęstsze mutacje germinalne) w celu kwalifikacji chorych na nowotwory do terapii inhibitorami PARP oraz wykrycia predyspozycji genetycznych do występowania chorób nowotworowych. Badania są wykonywane zarówno w materiale z bloczka parafinowego, jak i z krwi obwodowej.

(ang. homologous recombinant deficency – HRD) techniką NGS w celu kwalifikacji chorych na nowotwory do terapii inhibitorami PARP oraz w celu wykrycia genetycznej predyspozycji do występowania nowotworów.

(technika real-time PCR) w kwalifikacji chorych na nowotwory do terapii inhibitorami KIT i PDGFR.

(technika real-time PCR lub sekwencjonowanie Sangera) w kwalifikacji chorych na nowotwory do terapii inhibitorami PIK3CA.

mutacje w genie POLE techniką sekwencjonowania Sangera, zaburzenia ekspresji p53 techniką IHC, stwierdzenie dMMR techniką IHC i MSI techniką PCR w celu ustalenia rokowania po zabiegu operacyjnym oraz kwalifikacji do terapii adjuwantowych i immunoterapii.

techniką sekwencjonowania nowej generacji w kwalifikacji chorych na nowotwory do terapii inhibitorami AKT1, PTEN i PIK3CA.

metodą real-time PCR we krwi obwodowej w celu wykrycia predyspozycji do niedoboru dehydrogenazy dihydropirymidynowej odpowiedzialnej za występowanie toksyczności chemioterapii z udziałem 5’-fluorouracylu.

metodą real-time PCR we krwi obwodowej w celu wykrycia niedoboru metabolizmu wybranych leków, w tym stosowanych w leczeniu stwardnienia rozsianego.

Mutacje ESR1 występują u około 50% chorych na zaawansowanego, hormonalnie dodatniego i HER2-ujemego raka piersi, będąc główną przyczyną oporności na inhibitory aromatazy, co wymusza zmianę terapii. Mutacje te są wykrywane w wolnym krążącym DNA (circulating free DNA, cfDNA).

Mutacje promotora genu TERT występują w 30-90% guzów litych i zwiększają ekspresję telomerazy, umożliwiając komórkom nowotworowym nieograniczone podziały.
Są kluczowym czynnikiem prognostycznym wskazującym na gorsze rokowanie u chorych na raka tarczycy, wątrobowokomórkowego i pęcherza moczowego oraz u chorych na glejaki.
Białko MDM2 jest negatywnym regulatorem funkcji białka P53 i jego zwiększona ekspresja wpływa na inaktywację P53 nawet bez mutacji genu P53. W związku z tym jest negatywnym czynnikiem prognostycznym w wielu nowotworach, w tym przede wszystkim w mięsakach tkanek miękkich i kości.